凤眼菩提佛珠是藏传佛教极为推崇的佛珠品类之一，在藏传佛教中，菩提子佛珠即指凤眼菩提佛 珠。凤眼菩提是菩提子的一种，非常稀少名贵，因芽眼如目，固称“凤眼菩提”，凤眼象征祥瑞，用凤眼菩提制成的佛珠是密宗修行者必不可少的法器之一。打磨凤 眼是通过用专用油和腊打磨其表面并且抛光后使其色泽更加鲜明，更加光亮，因其非常坚硬，所以历久不变，而且越来越富有光泽，颜色越来越深，并形成包浆，这 样的凤眼菩提品质更高。
 

 近代对于汉地影响最大一位藏密祖师诺那活佛曾开示说：“最好有一串凤眼菩提子念珠， 修一切法均可通用，功德最大”。格鲁派祈竹仁波切也开示说：“佛陀是在菩提树下成道的，菩提珠本身的坚硬特质又有吉祥的表义，所以菩提珠适合作任何法门的 修持”。金安一居士所著《密宗辑要》一文也说：“修一切法均可用凤眼菩提子珠。”

 汉传佛教中，也不乏青睐凤眼菩提者。如净土宗大德黄念祖居士，他持用凤眼菩提，而且这串凤眼念珠在往生后化为念珠舍利（详见后面的资料）；台湾散文家林清玄居士也偏爱凤眼菩提，他著有一篇散文《凤眼菩提》，即以其珍爱的一串凤眼菩提为线索展开，颇为引人入胜。
 

用凤眼菩提子修持功德最大，其原因为何？对此，智敏慧华上师开示说：若了义地解（诺那）祖师之开示，乃指安住菩提心体，若持咒、甚或不持咒，皆具最大功德。
 

密教中由于三部(胎藏界)、五部(金刚界)修法之不同，对于佛珠也有着特殊的要求， 与平时常用的佛珠相比，是有所不同的。据《苏悉地羯罗经》说： “佛部用菩提子珠，观音部用莲花子珠，金刚部用噜椰罗叉子珠。”又据《守护经》及《瑜伽念珠经》说：“佛部用菩提子珠，金刚部用金刚子珠，宝部用金等诸宝 珠，莲花部用莲花子珠，羯磨部用种种和合珠。”又近人金安一居士所著《密宗辑要》一文说：“修增法用琥珀珠，修息法用水晶珠，修怀法及长寿法用珊瑚珠，修 诛法用人头骨珠，修观音法用菩提子珠，修一切法均可用凤眼菩提子珠。”